Władze nie ujawniły szczegółów na temat podejrzanych, ale Indonezja od lat zmaga się z zagrożeniem ze strony islamistów. W 2002 roku w zamachu na Bali zginęły 202 osoby, w tym polska dziennikarka. Aby zapewnić Ojcu Świętemu bezpieczeństwo, podczas jego wizyty w Indonezji rozlokowano 4 tys. funkcjonariuszy, w tym snajperów.

Indonezja, będąca największym krajem muzułmańskim na świecie, liczy ponad 240 milionów wyznawców islamu, co stanowi około 87% jej populacji. Chrześcijanie stanowią 11%, a pozostałe 2% to hinduiści, buddyści i konfucjaniści. Mimo konstytucyjnych gwarancji wolności religijnej do 1960 roku obowiązywał w tym kraju wymóg określenia religii w dokumentach tożsamości, ograniczający wybór do kilku wyznań. W ostatnich latach dodano nową kategorię dla osób praktykujących lokalne kulty, wybrało ją około 140 tys. mieszkańców Indonezji.